10x Genomics, Inc. a annoncé le lancement d'Atera, une nouvelle plateforme de biologie spatiale in situ conçue pour réaliser des analyses spatiales du transcriptome complet avec une sensibilité à l'échelle de la cellule unique et une envergure sans précédent. Atera est développée pour permettre des études spatiales transcriptomiques à grande échelle sur des tissus frais congelés ou fixés en paraffine (FFPE), répondant ainsi à diverses applications tant dans la recherche fondamentale que translationnelle. En levant les barrières actuelles, Atera permet une mesure exhaustive de la biologie dans son contexte natif, à une résolution cellulaire et à grande échelle, sans aucun compromis.
Atera marque un tournant fondamental dans l'analyse et la compréhension du vivant. Lors de la session plénière d'ouverture du congrès annuel 2026 de l'American Association for Cancer Research (AACR), Carl June présentera des données issues d'échantillons analysés par le June Lab via le programme d'accès anticipé d'Atera. Les données présentées à l'AACR par le Centre allemand de recherche sur le cancer (DKFZ) mettront en lumière la capacité d'Atera à remettre en question les paradigmes établis et à révéler des aspects de la biologie du cancer inaccessibles avec les méthodes conventionnelles.
Les chercheurs ont pu distinguer de multiples états malins et de cellules souches à différents stades de la maladie au sein d'un seul échantillon de tumeur colorectale, tout en cartographiant les interactions de ces populations avec le microenvironnement immunitaire environnant. Des tumeurs précédemment caractérisées par une infiltration immunitaire faible ou limitée se sont révélées abriter des populations de cellules immunitaires actives et diversifiées, dévoilant un paysage immunitaire plus complexe susceptible d'orienter les futures stratégies thérapeutiques et le développement de médicaments. Des organisations de premier plan dans les sciences de la vie et des instituts de recherche se sont déjà engagés à exploiter Atera à grande échelle, soulignant la forte demande pour des analyses spatiales à haut débit et haute sensibilité.
Alors que le projet Human Cell Atlas poursuit sa mission de cartographie de chaque type de cellule du corps humain, sa réussite dépendra d'une biologie spatiale sans compromis et à grande échelle ; Atera permettra au consortium d'atteindre ses prochains objectifs ambitieux. La transcriptomique spatiale du transcriptome complet transforme les tissus en cartes vivantes, permettant aux scientifiques de visualiser les interactions cellulaires complexes dans les pathologies, de découvrir des mécanismes occultes dans les spécimens cliniques et d'identifier de nouvelles cibles thérapeutiques. Les prestataires de services mondiaux s'apprêtent à adopter Atera pour soutenir la prochaine génération d'études spatiales.
Macrogen, une organisation de recherche sous contrat (CRO) d'envergure mondiale, ainsi que sa filiale américaine Psomagen, se sont engagées à déployer plusieurs instruments Atera, devenant ainsi le premier prestataire de services mondial à adopter la plateforme. Cet investissement reflète la demande croissante pour des analyses spatiales à haut débit dans les secteurs biopharmaceutique et translationnel. Atera capitalise sur la dynamique et le leadership établis par Xenium, qui demeure la solution de référence pour la génération de données spatiales. Bioptimus, une société de biotechnologie française spécialisée dans l'IA, a récemment annoncé son partenariat avec 10x pour constituer l'un des plus vastes ensembles de données spatiales au monde, STELA, une initiative mondiale destinée à alimenter leur plateforme d'IA multimodale, M-Optimus.
Ces données constitueront la pierre angulaire du moteur de découverte de médicaments et de biologie assistée par IA de Bioptimus. La société débute avec Xenium pour générer immédiatement des données spatiales de haute qualité et prévoit de passer à Atera en 2027, le débit accru permettant au programme de changer d'échelle. Atera repose sur une approche fondamentale visant à résoudre un défi majeur de la biologie : mesurer des systèmes complexes sans restrictions.
Le résultat est une plateforme qui fournit des données spatiales du transcriptome complet avec une sensibilité cellulaire à grande échelle. La plateforme Atera élargira considérablement le champ des questions pouvant être traitées en biologie spatiale. Pour exploiter la masse d'informations générée, 10x introduit une nouvelle plateforme d'analyse cloud pour stocker, analyser et visualiser les jeux de données de manière sécurisée.
S'appuyant sur les bases de Xenium Explorer, cette nouvelle plateforme intègre une visualisation intuitive sur le web et la couple à une analyse accélérée par GPU, permettant aux biologistes de transformer les données brutes en connaissances en quelques minutes. Les chercheurs conservent le plein contrôle de leurs données et flux de travail, Atera acheminant les résultats vers le Cloud 10x, un cloud géré par le client ou un stockage local. L'accessibilité d'Atera est cruciale pour maximiser son impact biologique.
Afin de garantir l'accès à cette plateforme quels que soient la taille du projet ou l'infrastructure, 10x a lancé Catalyst Research Services, permettant la soumission directe d'échantillons pour analyse. Le programme propose des forfaits d'accès flexibles, avec des pré-réservations déjà ouvertes et un traitement des échantillons débutant parallèlement à la disponibilité commerciale d'Atera. La plateforme sera présentée lors du congrès annuel de l'AACR 2026, où 10x organisera des événements de lancement physiques et numériques.
Présentation "Exhibitor Spotlight" : 10x Genomics présentera Atera, incluant une intervention du Centre allemand de recherche sur le cancer, le 19 avril à 13h30 PT au Spotlight Theater C du San Diego Convention Center. Poster #7116 : Atera permet des études spatiales à l'échelle clinique en surmontant les limites de coût et de flux de travail, générant des données haute résolution optimisées pour la découverte de biomarqueurs par IA. Poster #6216 : L'analyse spatiale du transcriptome complet avec Atera révèle les gènes de remodelage du microenvironnement tumoral et la signalisation mitotique au front d'invasion tumoral, offrant de nouvelles perspectives mécanistiques sur la progression tumorale et l'échappement immunitaire dans les cancers du col de l'utérus et du sein.
Les précommandes pour Atera sont désormais ouvertes. Les premières livraisons sont prévues pour le second semestre 2026. 10x Genomics avait anticipé le lancement d'Atera lors de la publication de ses perspectives financières annuelles pour 2026 en février dernier.
Des détails supplémentaires sont disponibles dans le dossier de presse d'Atera.
