Bionano Genomics, Inc. a annoncé la commercialisation de nouveaux kits pour son système de purification Ionic® comprenant une nouvelle chimie pour l'extraction d'acide nucléique à partir de tissus fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE) et de tissus tumoraux. Ces produits proposent des améliorations potentielles de la qualité et du rendement de l'acide nucléique extrait d'échantillons biologiques complexes, y compris ceux présentant un faible nombre de cellules ou d'autres types d'échantillons difficiles, tels que les échantillons de tumeurs FFPE. La plupart des échantillons cliniques utilisés dans la recherche oncologique sont stockés sous forme de tissus FFPE, qui contiennent souvent de l'acide nucléique dégradé ou fragmenté.

Les méthodes d'extraction conventionnelles demandent beaucoup de travail et peuvent endommager davantage l'acide nucléique au cours du processus d'extraction et de purification. Le système de purification ionique utilise l'isotachophorèse (ITP) pour extraire, purifier et concentrer l'acide nucléique des échantillons biologiques sans liaison, lavage ou décapage des surfaces fixes. Étant donné que les acides nucléiques restent sous leur forme native lors de l'utilisation du flux de travail ITP sur le système Ionic, il peut s'agir d'une solution idéale pour de nombreux types d'échantillons, y compris les échantillons de tumeurs solides et de déficience de recombinaison homologue (HRD) de qualité limitée et faible.

La chimie Ionic® G2 comprend quatre nouveaux kits à utiliser avec le système de purification Ionic, dont G2 FFPE to DNA, G2 FFPE to RNA, G2 FFPE Complete et G2 Tissue to DNA. Les kits Ionic G2 permettent à l'ITP de fournir jusqu'à 4,5 fois le rendement potentiel en acides nucléiques par rapport au système leader à base de colonnes, avec des résultats d'échantillons de meilleure qualité et un temps utile de traitement des échantillons réduit. L'ITP sur le système Ionic se concentre actuellement sur la purification de l'acide nucléique pour les applications de séquençage de nouvelle génération (NGS).

Bionano développe des solutions ITP pour la cartographie optique du génome (OGM) qui devraient être disponibles à l'avenir.