Bruker Corporation a annoncé une sensibilité transformatrice sur la plateforme 4D-Proteomics timsTOF avec le lancement du nouveau spectromètre de masse timsTOF Ultra. Il intègre une nouvelle source d'ions Captive Spray Ionization (CSI) Ultra avec un capillaire plus grand et un flux de gaz vortex optimisé, une cellule XR TIMS (séparation de la mobilité des ions piégés) de 4ème génération et un numériseur 14 bits. Le timsTOF Ultra peut identifier plus de 55 000 peptides qui se répartissent en 5 000 groupes de protéines au niveau d'une seule cellule avec une charge de 0,125 ng de protéines, avec un FDR de 1 %, et plus de 4 800 groupes de protéines quantifiés aux CV du spectromètre de masse timsTOF Ultra.

Ces progrès du timsTOF Ultra ont été réalisés sans compromettre l'excellente robustesse pour la protéomique à haut débit, par exemple à 50 échantillons par jour (SPD), ou même jusqu'à 398 SPD, ni la plus grande confiance d'identification de < 1 % de peptides et < 1 % de protéines FDR (faux taux de découverte), évitant la réactivité croisée observée avec les méthodes d'immuno-reconnaissance ciblées. Bruker présente également le logiciel VistaScan pour synchroniser la rampe TIMS avec le balayage quadripolaire afin de bénéficier davantage des informations sur la mobilité ionique à l'échelle. Cette rampe dynamique sophistiquée prend en charge le nouveau mode midia-PASEF, introduit par Stefan Tenzer.

En outre, le timsTOF Ultra dispose d'un mode d'acquisition dda-PASEF encore amélioré, augmentant la vitesse à 300 Hz pour un maximum de 18 000 spectres MS/MS à section efficace de collision (CCS) par minute, afin de permettre une protéomique 4D et une lipidomique 4D/métabolomique 4D approfondies avec des gradients LC très courts de quelques minutes seulement. La source d'ions CSI Ultra de Bruker, essentielle pour la plus grande sensibilité du nanoflow, a été optimisée pour le timsTOF Ultra en concentrant le gaz vortex à l'extrémité du nanospray pour améliorer la transmission des ions. Le vortex assure l'ionisation à travers les gradients pour des débits de 50 à 5000 nL/min.