Boiron a réalisé un chiffre d'affaires de 172,46 millions d'euros, en croissance de 3,3% (+5% à taux constant) au quatrième trimestre grâce notamment aux spécialités hivernales en France, aux Etats-Unis et en Espagne. Sur l'ensemble de l'année, le spécialiste des préparations pharmaceutiques homéopathiques a réalisé un chiffre d'affaires de 617,73 millions d'euros, en hausse de 9,1% (+10,2% à taux constant). Compte tenu de l'évolution de l'activité et de la maîtrise des charges, Boiron s'attend à ce que le résultat opérationnel 2013 soit en progression très significative par rapport à 2012.

Au 31 décembre 2013, la trésorerie nette du groupe est proche de 160 millions d'euros.

Le 24 janvier 2014, le comité central d'entreprise de Boiron SA s'est réuni dans le cadre d'une procédure d'information-consultation.

La direction générale a annoncé son intention de regrouper les deux établissements de distribution de la région lyonnaise sur le site de Francheville. Ce regroupement n'entraînerait pas de suppression de poste. Elle souhaite aussi réorganiser la direction informatique de Boiron SA. Ce projet, susceptible d'avoir des conséquences sociales, pourrait concerner une cinquantaine d'emplois d'ici 2018.