Khan, 69 ans, qui a dirigé pendant trois ans et demi ce pays d'Asie du Sud de 220 millions d'habitants, doté de l'arme nucléaire, avait accusé Washington de soutenir un complot visant à le destituer.
Il avait déclaré s'être rendu à Moscou contre l'avis des États-Unis. Washington nie cette accusation.
Asad Majeed, ancien ambassadeur du Pakistan aux États-Unis qui avait écrit un câble à Islamabad sur le point de vue de Washington concernant la visite de Khan à Moscou, a informé les dirigeants civils et militaires d'un forum appelé National Security Committee (NSC).
"Le NSC, après avoir examiné le contenu de la communication, l'évaluation reçue et la conclusion présentée par les agences de sécurité, conclut qu'il n'y a pas eu de conspiration", indique un communiqué du bureau du nouveau Premier ministre Shehbaz Sharif.
Il a déclaré que les principales agences d'espionnage du pays ont informé le NSC qu'elles n'avaient trouvé aucune preuve pour soutenir une quelconque théorie de conspiration.
Le parti Pakistan Tehrek-e-Insaf (PTI) de Khan a demandé une enquête judiciaire sur cette affaire.
Le dirigeant évincé a rencontré le président russe Vladimir Poutine le 24 février, le jour où les forces russes ont envahi l'Ukraine voisine.
Khan a d'abord bloqué la motion de censure, affirmant que le NSC avait approuvé la prétendue conspiration.
Les partis d'opposition et les analystes ont déclaré que l'armée avait aidé Khan à remporter l'élection en 2018, ce qu'ils nient tous les deux, mais que ce soutien s'était estompé après un désaccord sur la nomination du prochain chef des services de renseignement du pays à la fin de l'année dernière.
Khan a diffusé ses allégations de complot lors de trois énormes rassemblements publics qu'il a tenus depuis son éviction. Il a exigé des élections anticipées.
La prochaine élection parlementaire est prévue en 2023.
