L'ancien président s'était positionné comme un candidat pro-bitcoin dont le retour pourrait marquer une victoire pour l'industrie qui a accusé l'administration actuelle d'aller trop loin dans la réglementation.
Le bitcoin, la plus grande crypto-monnaie du monde, était en baisse de 1,6 % mercredi, tandis que l'éther reculait de 2 %.
"Le débat présidentiel américain n'a pas abordé directement la question des crypto-monnaies. Cependant, le sentiment du marché évolue en faveur de Kamala Harris", a déclaré Valentin Fournier, analyste à la société de recherche BRN.
"Cela crée des perspectives un peu moins optimistes pour le bitcoin par rapport aux projections plus enthousiastes faites par Trump lors de la conférence Bitcoin 2024."
Selon le site de paris en ligne PredictIt, les chances de victoire de Mme Harris sont passées de 53 % à 56 % avant le débat, tandis que celles de M. Trump sont passées de 52 % à 48 %.
En juillet, M. Trump avait courtisé l'industrie des cryptomonnaies lors d'une conférence, à la recherche de dons et de votes, en promettant une réglementation plus souple. Il avait alors déclaré : "Ne vendez jamais vos bitcoins".
À l'approche du débat, de nombreux acteurs du marché et analystes ont considéré le bitcoin comme l'actif à surveiller pour savoir quel candidat prenait l'avantage.
Le marché des crypto-monnaies est souvent considéré comme une activité marginale risquée et très volatile. Il a fait l'objet d'un examen minutieux de la part de la Securities and Exchange Commission des États-Unis, qui l'a accusé d'enfreindre les lois sur les valeurs mobilières.
Mais son attrait auprès du grand public s'est considérablement amélioré, grâce au soutien d'institutions de Wall Street et de titans de l'entreprise comme Elon Musk, et à l'approbation de fonds cryptographiques négociés en bourse aux États-Unis.
Les mineurs de crypto-monnaie Riot Platforms Marathon Digital et les actions de Hut 8 cotées en bourse aux États-Unis étaient en baisse de 2,5 % à 3,4 % avant la cloche.
L'éditeur de logiciels et acheteur de BTC MicroStrategy a chuté de 4 % et la bourse de crypto-monnaies Coinbase Global et l'opérateur de fermes de blockchain Bitfarms ont baissé de 2,5 % et 3 %, respectivement.