Kanu, citoyen britannique, s'est vu refuser une première fois la liberté sous caution en mars après son arrestation l'année dernière au Kenya après des années de fuite.
"La présente demande constitue un abus de procédure judiciaire pour avoir tenté de remettre en cause une question déjà tranchée par le tribunal", a déclaré la juge Binta Nyako, ajoutant que Kanu pouvait faire appel de sa décision.
Kanu, qui est en prison dans l'attente de son procès et nie les accusations portées contre lui, a fondé le Peuple indigène du Biafra (IPOB) en 2014. Le groupe a fait pression pour la sécession d'une partie du sud-est du Nigeria où la majorité de la population appartient à l'ethnie Igbo.
Les autorités considèrent toutefois l'IPOB comme un groupe terroriste et l'accusent d'une série de meurtres et d'attaques contre des bâtiments gouvernementaux dans le sud-est. L'IPOB affirme vouloir obtenir l'indépendance par des moyens non violents.
Une tentative des séparatistes Igbo de faire sécession sous le nom de République du Biafra en 1967 - l'année de naissance de Kanu - a déclenché une guerre civile de trois ans qui a tué plus d'un million de personnes.
